奈良县深山里的神濑中学因生源不足面临废校，仅剩七名学生。某天，他们在清理旧图书室时发现一本封面写着“新书·忍者”的古籍，书中跳出一个自称“卷物仙人”的式神。仙人告诉他们，神濑中学位于古代忍村的遗址上，七人正是末裔忍者的后代。孩子们半信半疑地开始学习古籍中的忍术——分身术其实是极速跑酷、隐身术实为光学迷彩伪装、火遁不过是化学粉末。他们用这些“科学忍术”在网络上发起拯救学校的挑战，引来媒体关注。但真正的危机来了，土地开发商雇佣了退役自卫队成员来捣乱。七名少年少女要在毕业典礼前，打一场现代版的“忍者防卫战”。
将传统忍术用现代科学解构，创意满分。七位主角各有成长线，不拖泥带水。打斗设计融合了跑酷和战术配合，既有少年漫的热血，又有日剧特有的温情与伤感。
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